Ok, wenn deine SSD tatsächlich defekt ist, würde ich einfach das vorhandene Backup zurückspielen - damit hast du das System am schnellsten wieder sauber am Laufen.
In deiner Schilderung sehe ich aktuell kein Proxmox-Problem, sondern eher Themen in der Konfiguration deiner Dienste (nginx etc.).