Wenn Du es, wie von denen präferiert, als docker betreibst, nimm eine VM. Docker in LXC ist nicht empfohlen. Wenn Du es in einem LXC betreiben möchtest, ist der Weg hier sehr rudimentär beschreiben.
Scanner könnte man vielleicht als USB-Device...
Wenn die Hardware vorhanden ist und Replikation keine grosse Rolle spielt, spricht in meinen Augen nichts gegen lvm-thin/ext4. Man sollte bei der Überlegung zfs/ext4 bei vorhandener Harware auch das Thema RAM im Hinterkopf haben.